matplotlib で AttributeError: max must be larger than min in range parameter
問題
matplotlib.pyplot をつかってヒストグラムを書いてみよう．
#!/usr/bin/env python3
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
filename = "myfile.tsv"
data = np.genfromtxt(filename, delimiter='\t')
plt.hist(data[:,5])
plt.show()すると
AttributeError: max must be larger than min in range parameter.とエラーが出てしまう． max や min を指定した覚えはないのにどうしたことだろうか．
解決
.tsv からの読み込みのときに入る(可能性のある) Nan が問題を引き起こしている．
np.genfromtxt はなかなかいい感じにいい感じで，欠損してる値に対しては np.nan を入れてくれる．
この np.nan がちょっとした性質を持っていて，これが（plt.hist が設定する）
max や min について問題を引き起こすわけだ．
a = np.nan
>>> a > 100
False
>>> a < 100
False
>>> a > -100000
False
>>> a > -np.inf
False
>>> a < np.inf
False
>>> a < a
False
>>> a == a
False
>>> a <= a
False
>>> a is a
Trueで，np.isnan あたりを使いつつ適宜
フィルタすればうまく行くっぽい．
ありがとうございました．